220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
456 aa  887    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  37.53 
 
 
458 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  39.69 
 
 
482 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  34.88 
 
 
455 aa  199  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  32.73 
 
 
488 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  39.33 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  35.2 
 
 
453 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 
481 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  32.51 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  40.62 
 
 
462 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.95 
 
 
483 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 
451 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  37.71 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  34.87 
 
 
450 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.01 
 
 
456 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  37.69 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.47 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  39.1 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  32.86 
 
 
457 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  34.31 
 
 
450 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  35.24 
 
 
500 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 
454 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  34.66 
 
 
463 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  35.11 
 
 
453 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  32.08 
 
 
463 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  31.64 
 
 
490 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  34.7 
 
 
462 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  41.38 
 
 
465 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  35.06 
 
 
450 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  35.38 
 
 
451 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  34.99 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.6 
 
 
459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  34.82 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 
441 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 
449 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  33.78 
 
 
471 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.5 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.93 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  35.85 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  35.85 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32 
 
 
454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 
441 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  34.36 
 
 
460 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  32.3 
 
 
449 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  34.86 
 
 
458 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 
458 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  39.04 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  38.86 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  33.33 
 
 
458 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
501 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 
446 aa  136  9e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  32.51 
 
 
481 aa  136  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.42 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  29.45 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 
468 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.66 
 
 
481 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  35.52 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.79 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  34.25 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.86 
 
 
454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  37.78 
 
 
442 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.25 
 
 
454 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  32.64 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  37.13 
 
 
439 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.09 
 
 
457 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 
454 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  26.55 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  35.41 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  35.75 
 
 
445 aa  126  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  36.93 
 
 
447 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.54 
 
 
467 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 
442 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  36.27 
 
 
443 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  32.35 
 
 
494 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  34.82 
 
 
454 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  34.39 
 
 
476 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  33.24 
 
 
456 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  33.74 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.57 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  36.13 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.59 
 
 
476 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.89 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  29.73 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  29.86 
 
 
474 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 
486 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.54 
 
 
458 aa  113  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  29.03 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
491 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.85 
 
 
469 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 
487 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  34.25 
 
 
444 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  35.83 
 
 
442 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 
477 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 
492 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>