294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  72.79 
 
 
317 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  73.74 
 
 
314 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  71.24 
 
 
318 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  73.06 
 
 
318 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  73.06 
 
 
314 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  77.63 
 
 
314 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  76.97 
 
 
314 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  73.48 
 
 
329 aa  401  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  68.71 
 
 
312 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  67.74 
 
 
312 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  36.42 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  37.92 
 
 
328 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  37.05 
 
 
312 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  37.01 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3160  hypothetical protein  36.36 
 
 
351 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  40.36 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  35.96 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  35.58 
 
 
303 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  36.39 
 
 
393 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  38.24 
 
 
318 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  38.8 
 
 
324 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  32.78 
 
 
319 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  41.88 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2462  hypothetical protein  42.67 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  29.84 
 
 
345 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2763  hypothetical protein  42.67 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.618762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  42.67 
 
 
317 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  42.24 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  42.67 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  35.05 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  34.65 
 
 
320 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1527  hypothetical protein  40.08 
 
 
311 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  39.83 
 
 
311 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3091  hypothetical protein  41.74 
 
 
327 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  37.21 
 
 
341 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  37.76 
 
 
324 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  36.33 
 
 
312 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  36.12 
 
 
334 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3799  hypothetical protein  33.55 
 
 
331 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.314785  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1405  hypothetical protein  41.3 
 
 
322 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000755973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1470  hypothetical protein  41.3 
 
 
322 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1458  hypothetical protein  41.3 
 
 
322 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000087198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2813  hypothetical protein  34.75 
 
 
322 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  37.16 
 
 
335 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2428  hypothetical protein  40.87 
 
 
309 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0340562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  35.5 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2601  hypothetical protein  39.57 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  35.06 
 
 
331 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  33.91 
 
 
330 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  34.98 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3114  hypothetical protein  35.12 
 
 
311 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.081808  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  30.88 
 
 
290 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  35.17 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  35.22 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  34.21 
 
 
302 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  31.91 
 
 
295 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  34.9 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  28.24 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  27.84 
 
 
287 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02347  hypothetical protein  36.71 
 
 
320 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  31.5 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.76 
 
 
291 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  34.98 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  32.5 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  33.77 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  31.2 
 
 
308 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  25.77 
 
 
287 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.34 
 
 
287 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1737  hypothetical protein  33.46 
 
 
306 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3234  protein of unknown function DUF58  37.92 
 
 
309 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.65 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  28.35 
 
 
295 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.84 
 
 
329 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  28.04 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  31.94 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  29.43 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.04 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  33.58 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  30.63 
 
 
340 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.46 
 
 
295 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.89 
 
 
353 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  33.09 
 
 
363 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  26.43 
 
 
296 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  34.69 
 
 
294 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  32.25 
 
 
302 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  33.21 
 
 
328 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  37.32 
 
 
328 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2471  protein of unknown function DUF58  37.74 
 
 
319 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  33.71 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0863  hypothetical protein  33.2 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0448863  normal  0.0441137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0185  protein of unknown function DUF58  31.12 
 
 
357 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0822  hypothetical protein  32.8 
 
 
309 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.292102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0457  protein of unknown function DUF58  37.59 
 
 
302 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.34 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  31.2 
 
 
350 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  28.16 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>