More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  76.62 
 
 		 539 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  74.21 
 
 		 542 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  74.4 
 
 		 543 aa  841    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 587 aa  1186    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  52.17 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.78 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  36.56 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  37.98 
 
 		 532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.98 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  33.75 
 
 		 554 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 		 562 aa  226  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 537 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  30.62 
 
 		 537 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 545 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  32.71 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  32.32 
 
 		 551 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.53 
 
 		 543 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 546 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  34.39 
 
 		 547 aa  198  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.81 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  32.37 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 545 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 554 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.58 
 
 		 551 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 555 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  29.29 
 
 		 560 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.26 
 
 		 550 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  29.18 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2749  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.954537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  25.83 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 544 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.27 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.274162  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.34 
 
 		 530 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  32.75 
 
 		 526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  32.75 
 
 		 526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.09 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  30.32 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  28.83 
 
 		 575 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  28.83 
 
 		 575 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.38 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  28.5 
 
 		 562 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 547 aa  123  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  29.67 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.74 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  25.74 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.71 
 
 		 575 aa  120  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.93 
 
 		 555 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.3 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.93 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  26.93 
 
 		 575 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.71 
 
 		 575 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 559 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 564 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 534 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.7 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 525 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.68 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.23 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 575 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 		 529 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 575 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 528 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 502 aa  113  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.05 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.05 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.05 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.44 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.82 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.63 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.13 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 565 aa  111  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.6 
 
 		 513 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 496 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  30.41 
 
 		 496 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  27.87 
 
 		 524 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>