More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  84.31 
 
 
1039 aa  1733    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  56.15 
 
 
1043 aa  1098    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  56.5 
 
 
1031 aa  1102    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  44.08 
 
 
1023 aa  840    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.23 
 
 
1061 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.39 
 
 
1039 aa  800    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.59 
 
 
1037 aa  1063    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  83.73 
 
 
1039 aa  1739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.81 
 
 
1039 aa  1800    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.97 
 
 
1034 aa  740    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.81 
 
 
1039 aa  1800    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.74 
 
 
1066 aa  732    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.73 
 
 
1071 aa  743    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.37 
 
 
1092 aa  891    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.07 
 
 
1066 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.71 
 
 
1049 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  58.69 
 
 
1043 aa  1185    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  79.87 
 
 
1048 aa  1651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.67 
 
 
1049 aa  1100    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  85.18 
 
 
1039 aa  1768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  55.5 
 
 
1075 aa  1097    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  53.58 
 
 
1066 aa  1038    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  38.68 
 
 
1036 aa  670    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  61.79 
 
 
1034 aa  1263    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.23 
 
 
1026 aa  735    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  43.53 
 
 
1041 aa  772    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  53.19 
 
 
1058 aa  1021    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  59.69 
 
 
1047 aa  1197    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  44.62 
 
 
1045 aa  830    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.67 
 
 
1049 aa  1116    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 
1039 aa  2050    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  56.08 
 
 
1047 aa  1078    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  82.87 
 
 
1039 aa  1727    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  55.86 
 
 
1043 aa  1124    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.42 
 
 
1054 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  56.73 
 
 
1049 aa  1093    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.76 
 
 
1053 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  84.22 
 
 
1039 aa  1736    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 
1040 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  53.12 
 
 
1058 aa  1031    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.58 
 
 
1048 aa  1133    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.44 
 
 
1037 aa  1078    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 
1052 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  42 
 
 
1030 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.65 
 
 
1064 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.29 
 
 
1029 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.77 
 
 
1070 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.86 
 
 
1070 aa  589  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 
1070 aa  589  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.86 
 
 
1070 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.92 
 
 
1033 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.35 
 
 
1070 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 
1065 aa  581  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  36.64 
 
 
1032 aa  579  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.64 
 
 
1077 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.64 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.76 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.64 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 
1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.45 
 
 
1077 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.1 
 
 
1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.18 
 
 
1083 aa  572  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 
1066 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  36.02 
 
 
1075 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.78 
 
 
1063 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.89 
 
 
1070 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  36.65 
 
 
1052 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.78 
 
 
1063 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.99 
 
 
1049 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 
1070 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  33.43 
 
 
1053 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  33.43 
 
 
1053 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.13 
 
 
1059 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.62 
 
 
1062 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.43 
 
 
1053 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 
1070 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.75 
 
 
1040 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  36.05 
 
 
1023 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.43 
 
 
1053 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.03 
 
 
1051 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.73 
 
 
1075 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 
1068 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  33.72 
 
 
1061 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.49 
 
 
1069 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.15 
 
 
1062 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.87 
 
 
1082 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.77 
 
 
1068 aa  556  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  34.97 
 
 
1031 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.93 
 
 
1068 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 
1068 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.47 
 
 
1076 aa  555  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.71 
 
 
1022 aa  552  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  32.86 
 
 
1075 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.21 
 
 
1050 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
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NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  36.76 
 
 
1039 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  34.72 
 
 
1048 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1054 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  35.91 
 
 
1022 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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