23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17920 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  64.96 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  66.53 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  64.66 
 
 		 253 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  65.16 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  63.97 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  64.88 
 
 		 243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  62.81 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  62.4 
 
 		 258 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  46.09 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  45.08 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  45.08 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  25.82 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  30.52 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  28.77 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  32.93 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  32.08 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  32.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  32.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  30.19 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  30.82 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2656  hypothetical protein  26.47 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352143  normal  0.335343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>