More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16470  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  82.01 
 
 		 292 aa  487  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3870  putative transcriptional regulator  77.35 
 
 		 289 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.618692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  73.01 
 
 		 291 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  68.99 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 294 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4725  LysR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  58.19 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5263  LysR family transcriptional regulator  64.57 
 
 		 228 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4339  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3526  LysR substrate-binding  41.32 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.41 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1392  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000534606  normal  0.185395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1715  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  38.01 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  37.11 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  36.55 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  35.76 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.46 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 289 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6347  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.264946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1482  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  36.24 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7013  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  35.27 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2490  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0105522  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2115  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.477701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  35.34 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0839  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.771385  hitchhiker  0.0000128794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  36.7 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 335 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0814  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3521  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0846  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.579018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>