More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  100 
 
 
569 aa  1149    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  55.81 
 
 
579 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  54.2 
 
 
575 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  51.1 
 
 
545 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.67 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.18 
 
 
568 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  46 
 
 
578 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  44.86 
 
 
578 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.91 
 
 
553 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.53 
 
 
568 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.11 
 
 
568 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.82 
 
 
585 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.35 
 
 
558 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.36 
 
 
568 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
568 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.55 
 
 
871 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.73 
 
 
566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42.68 
 
 
559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  43.09 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.79 
 
 
571 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.8 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 
563 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.36 
 
 
555 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
573 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
564 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.05 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  51.09 
 
 
520 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  41.19 
 
 
577 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  51.22 
 
 
520 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
580 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.72 
 
 
571 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.3 
 
 
570 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
553 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  40.7 
 
 
594 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
556 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.57 
 
 
520 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  52.74 
 
 
487 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.31 
 
 
568 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  40.81 
 
 
550 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.49 
 
 
568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.49 
 
 
568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.12 
 
 
520 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
553 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.14 
 
 
557 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 
603 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.51 
 
 
564 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.75 
 
 
570 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
787 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  38.87 
 
 
582 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  38.58 
 
 
563 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  39 
 
 
637 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  50.91 
 
 
477 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  52.06 
 
 
469 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  41.93 
 
 
574 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.06 
 
 
469 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  46.68 
 
 
482 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  50 
 
 
514 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 
533 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  54.07 
 
 
468 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  47.25 
 
 
499 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.05 
 
 
571 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 
599 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  48.23 
 
 
514 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  52.45 
 
 
471 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 
599 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  50.65 
 
 
500 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.53 
 
 
577 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.99 
 
 
577 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
553 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.75 
 
 
599 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  42.78 
 
 
557 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
520 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  48.48 
 
 
497 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
558 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  39.76 
 
 
589 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  40.32 
 
 
574 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 
521 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
577 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.99 
 
 
568 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  48.24 
 
 
497 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  41.04 
 
 
574 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
885 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  42.21 
 
 
583 aa  379  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  40.65 
 
 
585 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  50.62 
 
 
503 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 
518 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  48.24 
 
 
497 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  47.58 
 
 
518 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.03 
 
 
558 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  49.49 
 
 
503 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.39 
 
 
501 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
561 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  41.49 
 
 
598 aa  382  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  47.42 
 
 
493 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  42.93 
 
 
563 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  37.66 
 
 
577 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  53 
 
 
486 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  49.01 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  47.42 
 
 
493 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  39.36 
 
 
566 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>