More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  100 
 
 		 270 aa  530  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  59.02 
 
 		 270 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  58.27 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  57.72 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  59.23 
 
 		 271 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  57.54 
 
 		 269 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  57.09 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  57.09 
 
 		 270 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  57.85 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.19 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  35.39 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  37.07 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.58 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  36.43 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.37 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  36.36 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  36.36 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.11 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 205 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 		 374 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  41.32 
 
 		 185 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.52 
 
 		 219 aa  92  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.52 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 236 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 		 587 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.62 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  36.92 
 
 		 220 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.41 
 
 		 398 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.84 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  37.69 
 
 		 220 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.97 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  86.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.29 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 206 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 220 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 200 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  44.35 
 
 		 222 aa  85.5  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 215 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 215 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 215 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.14 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.88 
 
 		 169 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  44.66 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.14 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  38.06 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  38.46 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  37.69 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.4 
 
 		 542 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  37.69 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  37.69 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  38.35 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 1755 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.06 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  39.23 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  36.23 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>