More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 		 328 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  76.22 
 
 		 330 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  74.23 
 
 		 328 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  77.13 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  75.15 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  76.83 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  72.7 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  73.01 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  73.01 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  72.7 
 
 		 328 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  76.38 
 
 		 327 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.58 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.08 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  38.6 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  42.06 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  34.46 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  39.63 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.04 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3492  DNA polymerase III subunit delta'  35.94 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000181629  normal  0.0164304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0719  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.34 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1692  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0197649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2801  DNA polymerase III subunit delta'  35.67 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.162966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1584  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000282591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.12 
 
 		 368 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  36.01 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2497  DNA polymerase III subunit delta'  33.87 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0020165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  36.16 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.1 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.2 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1593  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.27 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  42.53 
 
 		 337 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  40.48 
 
 		 320 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  42.4 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1614  DNA polymerase III subunit delta'  33.13 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000870759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.42 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  39.34 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.78 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  39.58 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.44 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  37.93 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1912  DNA polymerase III subunit delta'  35.6 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735581  hitchhiker  0.00000697955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  46.84 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.03 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1486  DNA polymerase III subunit delta'  34.46 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.585523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  39.91 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1629  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.37 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000209012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  35.69 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  31.34 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  35.81 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.8 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1924  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.33 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  38.97 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.17 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  41.05 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  41.05 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  41.05 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  40.18 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  41.05 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  40.58 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  44.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1095  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.26 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  43.93 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  46.26 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  40.62 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.39 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  40.48 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  40.09 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.77 
 
 		 374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1315  DNA polymerase III subunit delta'  40.2 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000035358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2050  DNA polymerase III, delta prime subunit  42.5 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1277  DNA polymerase III subunit delta'  39.71 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.867386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1985  DNA polymerase III subunit delta'  39.11 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000277224  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2168  DNA polymerase III subunit delta'  39.71 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000087583 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1300  DNA polymerase III subunit delta'  39.71 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0293645  hitchhiker  0.00000000000521382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  33.54 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01095  DNA polymerase III subunit delta'  32.42 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0362811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01103  hypothetical protein  32.42 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1221  DNA polymerase III subunit delta'  32.42 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2028  DNA polymerase III subunit delta'  32.42 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000033373  hitchhiker  0.00000172568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  38.96 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  39.34 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2502  DNA polymerase III subunit delta'  32.42 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0601626  unclonable  0.0000000133067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.42 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000249721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1478  DNA polymerase III subunit delta'  32.11 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000175371  hitchhiker  0.00000000166006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  34.16 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.58 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2225  DNA polymerase III subunit delta'  32.11 
 
 		 334 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000129004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2303  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.43 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1220  DNA polymerase III subunit delta'  32.11 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0878  DNA polymerase III subunit delta'  37.5 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  26.33 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  30.12 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  41.23 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.94 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>