96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  354  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  68.05 
 
 
175 aa  261  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  68.64 
 
 
208 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  68.1 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  68.1 
 
 
177 aa  248  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  64.53 
 
 
172 aa  247  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  70.44 
 
 
210 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  67.46 
 
 
212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  47.37 
 
 
174 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  47.93 
 
 
169 aa  176  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  47.09 
 
 
174 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  49.39 
 
 
185 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  44.97 
 
 
169 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  45.29 
 
 
176 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  44.38 
 
 
174 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  46.15 
 
 
169 aa  167  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  46.75 
 
 
169 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  45.03 
 
 
171 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  44.05 
 
 
168 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  42.01 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  44.05 
 
 
168 aa  162  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  42.53 
 
 
180 aa  160  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  46.29 
 
 
177 aa  160  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  43.2 
 
 
169 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  45.83 
 
 
168 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  43.79 
 
 
169 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  42.01 
 
 
169 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  42.01 
 
 
169 aa  157  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  46.79 
 
 
163 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  43.11 
 
 
167 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  47.67 
 
 
198 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  42.14 
 
 
159 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.87 
 
 
188 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  50.38 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  42.77 
 
 
196 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  34.92 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  35.45 
 
 
197 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  38.15 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  38.81 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  31.76 
 
 
163 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  31.82 
 
 
198 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  35.93 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  35.48 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  33.13 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  29.94 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  30.68 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  28.81 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  31.9 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  30.49 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  26.06 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  30.92 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  33.09 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  28.66 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  28.66 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.36 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.36 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  22.56 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  24.81 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  26.02 
 
 
147 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  28.07 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  27.91 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  28.99 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  25.2 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  23.28 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  28.26 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  30.36 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  27.54 
 
 
218 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  27.78 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  25.2 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  29.84 
 
 
151 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  30.28 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  27.15 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  26.32 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  28.16 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  31.9 
 
 
210 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  31.36 
 
 
146 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  29.6 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.13 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  30.91 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  27.64 
 
 
162 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  26.36 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  24.44 
 
 
234 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  25.18 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  24.36 
 
 
218 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  29.91 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>