More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03737  fused 3-hydroxybutyryl-CoA epimerase/delta(3)-cis-delta(2)-trans-enoyl-CoA isomerase/enoyl-CoA hydratase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  56.22 
 
 
729 aa  768    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4135  fatty oxidation complex, alpha subunit FadB  56.36 
 
 
729 aa  789    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  70.87 
 
 
715 aa  1017    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  71.01 
 
 
715 aa  1021    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.281306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.15 
 
 
722 aa  777    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.32 
 
 
716 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  70.59 
 
 
721 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4309  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
771 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.956942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.62 
 
 
716 aa  756    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  70.87 
 
 
715 aa  1024    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  71.71 
 
 
721 aa  1032    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1395  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  50 
 
 
715 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  54.67 
 
 
719 aa  766    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4213  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
729 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.31 
 
 
715 aa  935    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16390  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.6 
 
 
710 aa  737    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.94 
 
 
729 aa  768    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
715 aa  1430    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.04 
 
 
716 aa  773    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
716 aa  780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  70.59 
 
 
715 aa  1022    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4365  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
729 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0869233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  70.77 
 
 
715 aa  1019    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.86 
 
 
716 aa  852    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.76 
 
 
729 aa  789    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3747  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  54.89 
 
 
730 aa  763    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  54.69 
 
 
729 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.9 
 
 
716 aa  772    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.62 
 
 
716 aa  782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214886  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0019  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.6 
 
 
716 aa  775    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00182619  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.52 
 
 
721 aa  763    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000436351  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4369  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
771 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  54.33 
 
 
723 aa  739    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2534  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.23 
 
 
723 aa  754    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.386757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4164  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
729 aa  769    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.62 
 
 
716 aa  783    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
729 aa  770    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00427861  hitchhiker  0.00453732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.14 
 
 
727 aa  850    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
716 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000356561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  70.87 
 
 
715 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  54.11 
 
 
719 aa  759    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.31 
 
 
719 aa  791    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.94 
 
 
729 aa  768    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
717 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
716 aa  781    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000906563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.94 
 
 
729 aa  767    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4234  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.5 
 
 
729 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.535693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00460  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.35 
 
 
723 aa  731    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4069  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
729 aa  770    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.94 
 
 
729 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2974  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.57 
 
 
726 aa  748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0201  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.18 
 
 
719 aa  802    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4262  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.64 
 
 
729 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.18 
 
 
716 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0281216  hitchhiker  0.000170184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5285  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.22 
 
 
729 aa  790    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.427005  normal  0.014724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.04 
 
 
716 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  0.0928746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.48 
 
 
716 aa  789    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03736  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.07 
 
 
716 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4190  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.5 
 
 
729 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0458015  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03686  hypothetical protein  56.22 
 
 
729 aa  768    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  72.41 
 
 
715 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4316  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.36 
 
 
729 aa  769    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.54826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4044  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
729 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  72.27 
 
 
715 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0024  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.18 
 
 
716 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00830663  hitchhiker  0.0000000474346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.62 
 
 
716 aa  781    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000142726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2350  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.16 
 
 
711 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702817  normal  0.449344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1660  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  50.56 
 
 
722 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.12 
 
 
724 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.91 
 
 
744 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.74 
 
 
714 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  39.12 
 
 
714 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.34 
 
 
719 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3156  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.33 
 
 
764 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0879697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.45 
 
 
714 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.41 
 
 
708 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.16 
 
 
714 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.85 
 
 
706 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.88 
 
 
714 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  36.88 
 
 
714 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
714 aa  392  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.57 
 
 
715 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.99 
 
 
717 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.88 
 
 
714 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  36.74 
 
 
714 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2528  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
715 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
715 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2577  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
715 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.797066  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.68 
 
 
752 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2617  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.88 
 
 
715 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595901  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2630  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
715 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227424 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35240  predicted protein  35.38 
 
 
684 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.74 
 
 
714 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.31 
 
 
708 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.07 
 
 
706 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.0000561354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.11 
 
 
710 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.44 
 
 
727 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002857  fatty oxidation complex alpha subunit FadJ  35.15 
 
 
703 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.89 
 
 
706 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.89 
 
 
706 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>