More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14170 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  76.03 
 
 		 149 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  77.93 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  77.93 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  71.92 
 
 		 146 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  71.92 
 
 		 146 aa  196  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  69.86 
 
 		 146 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  69.86 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  69.18 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  68.92 
 
 		 153 aa  185  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  70.83 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  51.41 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  52.08 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  51.75 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  47.86 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  45.33 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  39.58 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  38.89 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  96.7  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  37.84 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  37.41 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  37.41 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  39.31 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  40 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  39.58 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.36 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  31.65 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  29.56 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  29.56 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.14 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  31.29 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.25 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  29.37 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02048  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  59.26 
 
 		 69 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00697742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.27 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.27 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.45 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.56 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  32 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.29 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.88 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  30.67 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.67 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  32.92 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  30.67 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.07 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.66 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  32.92 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.28 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.11 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  30.82 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  27.33 
 
 		 515 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.94 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.21 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  28.77 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.19 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.68 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  45.16 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  32.87 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  29.66 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.29 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.86 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  32.8 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.93 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.14 
 
 		 627 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.56 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.68 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.09 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  27.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.34 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  30.2 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  27.21 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>