More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_14020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
369 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  79.89 
 
 
369 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  76.96 
 
 
369 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  79.56 
 
 
368 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  76.69 
 
 
369 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  76.42 
 
 
369 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  78.37 
 
 
369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  79.18 
 
 
353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  80.58 
 
 
360 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  80.58 
 
 
360 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  77.13 
 
 
357 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  60.53 
 
 
358 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  56.1 
 
 
361 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  55.65 
 
 
369 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  56.03 
 
 
375 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  55 
 
 
355 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  57.14 
 
 
347 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  53.87 
 
 
357 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  54.15 
 
 
359 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  53.02 
 
 
386 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  51.69 
 
 
361 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  53.35 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  51.41 
 
 
365 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  51.69 
 
 
410 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  53.75 
 
 
358 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  53.75 
 
 
358 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 
356 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 
354 aa  332  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  48.42 
 
 
355 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  50.67 
 
 
376 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  49.71 
 
 
348 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  49.13 
 
 
355 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  46.47 
 
 
405 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  50.69 
 
 
415 aa  315  9e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  50.7 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  52.37 
 
 
389 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  45.28 
 
 
378 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.63 
 
 
366 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.83 
 
 
259 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  61.76 
 
 
257 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  62.18 
 
 
257 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  61.76 
 
 
257 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  61.76 
 
 
257 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  61.34 
 
 
257 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  61.92 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  47.92 
 
 
360 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  47.92 
 
 
360 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  47.26 
 
 
355 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  43.7 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.94 
 
 
342 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
346 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  43.99 
 
 
342 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  60.08 
 
 
257 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  45.01 
 
 
377 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  47.79 
 
 
390 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 
349 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 
343 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.3 
 
 
349 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.64 
 
 
342 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  44.31 
 
 
349 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.84 
 
 
349 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  44.31 
 
 
349 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
387 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  44.02 
 
 
349 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.33 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.73 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  42.82 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
341 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  43.44 
 
 
349 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  45.06 
 
 
368 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44.13 
 
 
389 aa  269  7e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  44.15 
 
 
350 aa  269  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  43.79 
 
 
343 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.75 
 
 
342 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.48 
 
 
346 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
256 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.69 
 
 
349 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.25 
 
 
256 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
367 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
343 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  43.8 
 
 
361 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  48.87 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.41 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  39.65 
 
 
361 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.26 
 
 
378 aa  253  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 
348 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.11 
 
 
366 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 
353 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
361 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  46.18 
 
 
352 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  43.56 
 
 
347 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 
353 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.32 
 
 
346 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>