205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  74.51 
 
 		 515 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  75.49 
 
 		 515 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  74.7 
 
 		 516 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  73.01 
 
 		 516 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  76.11 
 
 		 519 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  74.12 
 
 		 515 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  100 
 
 		 515 aa  1010    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  74.51 
 
 		 515 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  47.7 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  46.18 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  46.01 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 465 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  46.04 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 550 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  70.65 
 
 		 598 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  41.43 
 
 		 550 aa  346  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 475 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  62.25 
 
 		 594 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  61.92 
 
 		 594 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  42 
 
 		 450 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  40.28 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  33.21 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  53.73 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  55.56 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  54.41 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  52.68 
 
 		 466 aa  220  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 454 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  51.4 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 452 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  55.87 
 
 		 462 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  34.55 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  33.27 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  54.19 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  49.25 
 
 		 1565 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  49.25 
 
 		 1565 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  50.25 
 
 		 449 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 		 444 aa  203  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  31.05 
 
 		 450 aa  203  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  30.92 
 
 		 447 aa  200  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  53.89 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  30.34 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  28.63 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  31.18 
 
 		 409 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  29.14 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  44.6 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  47.72 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  48.9 
 
 		 443 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  45 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  30.91 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 450 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  36.48 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  39.45 
 
 		 419 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  38.46 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  40.34 
 
 		 495 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  39.42 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  38.49 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 576 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  38.08 
 
 		 491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  38.08 
 
 		 491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  38.79 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  38.79 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  38.79 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  41.06 
 
 		 428 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  29.77 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  38.91 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>