More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  100 
 
 
383 aa  763    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  74.61 
 
 
385 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  75.33 
 
 
386 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  75.33 
 
 
386 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  75.07 
 
 
402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  77.39 
 
 
380 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  75.13 
 
 
386 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  74.33 
 
 
386 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  73.53 
 
 
386 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  75.67 
 
 
389 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  75.67 
 
 
389 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.63 
 
 
412 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.71 
 
 
408 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  53.4 
 
 
385 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  52.56 
 
 
407 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  52.17 
 
 
401 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.17 
 
 
401 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  51.79 
 
 
402 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  52.17 
 
 
401 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.17 
 
 
401 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  52.17 
 
 
407 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.17 
 
 
401 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.17 
 
 
401 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  56.16 
 
 
404 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  52.43 
 
 
402 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  52.43 
 
 
402 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  50.8 
 
 
398 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  52.69 
 
 
402 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  52.43 
 
 
402 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  56.16 
 
 
404 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  52.43 
 
 
402 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  53.19 
 
 
388 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  52.93 
 
 
387 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.66 
 
 
398 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  51.53 
 
 
403 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  51.54 
 
 
403 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  52.66 
 
 
388 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.15 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  50.94 
 
 
383 aa  355  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.89 
 
 
417 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  52.12 
 
 
396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  51.33 
 
 
372 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.71 
 
 
383 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.61 
 
 
398 aa  346  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.95 
 
 
390 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  52.23 
 
 
392 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.83 
 
 
380 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.55 
 
 
379 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  47.68 
 
 
443 aa  323  3e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  49.21 
 
 
383 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.79 
 
 
388 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.72 
 
 
384 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  51.72 
 
 
386 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.15 
 
 
513 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.12 
 
 
385 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  51.86 
 
 
379 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  52.33 
 
 
385 aa  309  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.59 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  45.67 
 
 
384 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  51.29 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.65 
 
 
442 aa  305  6e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  50.15 
 
 
468 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  48.62 
 
 
350 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  46.39 
 
 
472 aa  296  6e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  45.37 
 
 
465 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  47.11 
 
 
496 aa  293  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  50 
 
 
463 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  48.36 
 
 
464 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  47.02 
 
 
457 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  47.24 
 
 
474 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  47.24 
 
 
474 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  47.71 
 
 
464 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  47.38 
 
 
471 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  46.18 
 
 
511 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  48.62 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  48.48 
 
 
467 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.43 
 
 
391 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.32 
 
 
464 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.92 
 
 
472 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  46.85 
 
 
476 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  44.44 
 
 
485 aa  276  6e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.81 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  40.92 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.23 
 
 
474 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  44.95 
 
 
476 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  44.29 
 
 
360 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  44.29 
 
 
360 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  44.29 
 
 
360 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  43.61 
 
 
458 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  44.29 
 
 
360 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  43.71 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.97 
 
 
476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  44.75 
 
 
393 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  42.86 
 
 
479 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.14 
 
 
476 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  44.44 
 
 
474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.7 
 
 
476 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  44.95 
 
 
473 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.5 
 
 
478 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  45.71 
 
 
491 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>