12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10950  alginate biosynthesis protein Alg44  100 
 
 		 388 aa  795    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00119266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1029  type IV pilus assembly PilZ  63.57 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.434326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0958  alginate biosynthesis protein Alg44  61.28 
 
 		 389 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1061  alginate biosynthesis protein Alg44  61.48 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248075  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18550  alginate biosynthesis protein Alg44  62.02 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.048678  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1603  alginate biosynthesis protein Alg44  62.27 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1241  alginate biosynthesis protein Alg44  61.13 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0887  type IV pilus assembly PilZ  58.72 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1286  type IV pilus assembly PilZ  57.95 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4439  type IV pilus assembly PilZ  57.95 
 
 		 388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176977  normal  0.491709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4563  type IV pilus assembly PilZ  58.46 
 
 		 388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1675  type IV pilus assembly PilZ  27.49 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>