More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  567  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  54.74 
 
 
292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  54.74 
 
 
292 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  54.21 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  49.27 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  53.85 
 
 
288 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  52.01 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  50.37 
 
 
311 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  50 
 
 
292 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  46.54 
 
 
294 aa  239  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  48.52 
 
 
288 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  48.88 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.75 
 
 
313 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  41.24 
 
 
311 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  41.13 
 
 
315 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  41.22 
 
 
310 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  39.86 
 
 
301 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  38.68 
 
 
301 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 
314 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  39.93 
 
 
300 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  39.44 
 
 
316 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  40.08 
 
 
295 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  36.76 
 
 
317 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  37.32 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  36.05 
 
 
310 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  37.17 
 
 
304 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  41.39 
 
 
310 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  37.54 
 
 
317 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  38.72 
 
 
295 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  34.08 
 
 
294 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  33.58 
 
 
289 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  32.12 
 
 
320 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.58 
 
 
294 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.58 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  37.04 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  34.01 
 
 
308 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 
293 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  35.87 
 
 
307 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.79 
 
 
301 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  31.1 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.91 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  32.71 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  33.69 
 
 
289 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.47 
 
 
308 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  35.29 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.86 
 
 
291 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  33.45 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.21 
 
 
347 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
333 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.23 
 
 
317 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.82 
 
 
309 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  32.52 
 
 
295 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  34.62 
 
 
306 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  32.22 
 
 
309 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  32.59 
 
 
297 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  35.03 
 
 
305 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.22 
 
 
331 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  34.6 
 
 
317 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.11 
 
 
299 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  31.67 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  35.1 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.2 
 
 
324 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  34.69 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.71 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.32 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  35.59 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  32.06 
 
 
294 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  31.1 
 
 
319 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  30.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  31.16 
 
 
299 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  30.85 
 
 
307 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.76 
 
 
298 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  33.17 
 
 
305 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  33.47 
 
 
313 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  30.2 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  35.02 
 
 
302 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.07 
 
 
285 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.66 
 
 
331 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.25 
 
 
324 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  28.36 
 
 
304 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
301 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  30.74 
 
 
307 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
299 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  32.37 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  32.72 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>