128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
224 aa  437  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  74.55 
 
 
224 aa  321  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  73.21 
 
 
224 aa  313  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  73.66 
 
 
224 aa  302  3e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  75.89 
 
 
224 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  60.71 
 
 
224 aa  252  4e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  68.28 
 
 
223 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  67.4 
 
 
223 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  43.66 
 
 
226 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  43.69 
 
 
230 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  41.63 
 
 
227 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  45.05 
 
 
226 aa  140  1e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  41.47 
 
 
228 aa  140  2e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  45.25 
 
 
236 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  41.56 
 
 
230 aa  139  4e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  47.64 
 
 
238 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  43.42 
 
 
230 aa  134  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  46.12 
 
 
230 aa  134  1e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  38.12 
 
 
221 aa  133  2e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  45.66 
 
 
226 aa  133  2e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  45.66 
 
 
226 aa  133  2e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  43.98 
 
 
259 aa  133  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  45.21 
 
 
226 aa  132  4e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  45.41 
 
 
226 aa  132  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  43.84 
 
 
226 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  46.15 
 
 
226 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  43.86 
 
 
229 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  41.92 
 
 
229 aa  130  1e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
226 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
236 aa  130  2e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
236 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  45.37 
 
 
229 aa  130  2e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
226 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  45.21 
 
 
226 aa  130  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
236 aa  130  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  44.75 
 
 
236 aa  130  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  44.75 
 
 
236 aa  130  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  46.12 
 
 
226 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  44.29 
 
 
226 aa  129  4e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  41.1 
 
 
231 aa  128  8e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  40.72 
 
 
235 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  38.64 
 
 
229 aa  120  2e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  37.62 
 
 
230 aa  119  4e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  33.6 
 
 
269 aa  119  5e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  39.73 
 
 
228 aa  117  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  37.1 
 
 
227 aa  115  4e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  37.16 
 
 
233 aa  114  2e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  38.99 
 
 
253 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  40.47 
 
 
227 aa  111  7e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  38.18 
 
 
251 aa  111  8e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  37.9 
 
 
223 aa  110  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  40 
 
 
225 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  38.3 
 
 
250 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  36.7 
 
 
232 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  33.01 
 
 
208 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  32.88 
 
 
232 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  34.74 
 
 
241 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  40.99 
 
 
237 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  34.93 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  34.39 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  37.66 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  32.74 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
240 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  37.85 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  35.14 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  36.56 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  34.86 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  38.67 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  35.94 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  36.15 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  35.48 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  32.31 
 
 
288 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  37.73 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  35.65 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
309 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  33.77 
 
 
223 aa  84.7  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  31.96 
 
 
244 aa  83.2  3e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
225 aa  83.2  3e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.44 
 
 
240 aa  82.4  5e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  32.88 
 
 
240 aa  81.6  8e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  35.02 
 
 
224 aa  80.1  2e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.8 
 
 
227 aa  79.3  4e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19211  urease accessory protein UreF  29.69 
 
 
223 aa  79.7  4e-14  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 
228 aa  79  5e-14  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  34.72 
 
 
225 aa  79  6e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  31.51 
 
 
238 aa  78.6  7e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  31.44 
 
 
231 aa  77  2e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  32.88 
 
 
223 aa  77  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 
210 aa  76.3  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
210 aa  76.3  4e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  24.23 
 
 
228 aa  75.5  6e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  34.7 
 
 
228 aa  75.5  6e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  31.98 
 
 
214 aa  75.5  7e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1050  urease accessory protein ureF  29.52 
 
 
223 aa  75.1  7e-13  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.713958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  32.42 
 
 
224 aa  75.1  8e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  31.39 
 
 
220 aa  74.3  1e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  31.72 
 
 
228 aa  72.8  4e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  30.84 
 
 
210 aa  72.8  5e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>