118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  70.75 
 
 
584 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  100 
 
 
586 aa  1177    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  51.41 
 
 
576 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  47.12 
 
 
586 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  42.83 
 
 
580 aa  452  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  39.07 
 
 
684 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  38.85 
 
 
610 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  38.67 
 
 
613 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  40.26 
 
 
599 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  37.43 
 
 
519 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  31.79 
 
 
628 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  31.83 
 
 
594 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  36.14 
 
 
555 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  30.89 
 
 
1148 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  32.07 
 
 
578 aa  174  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.42 
 
 
645 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.43 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.43 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  26.59 
 
 
602 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.59 
 
 
602 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  31.2 
 
 
1153 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  26.23 
 
 
602 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28.92 
 
 
601 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  28.48 
 
 
578 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  28.48 
 
 
578 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  29.87 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.47 
 
 
602 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  31.85 
 
 
593 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.68 
 
 
610 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.07 
 
 
602 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  30.85 
 
 
570 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.29 
 
 
602 aa  150  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  31.34 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  26.82 
 
 
606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  28.25 
 
 
596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  27.73 
 
 
591 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  28.67 
 
 
608 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  31.95 
 
 
594 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  31.74 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.19 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  31.67 
 
 
595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.32 
 
 
810 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  29.44 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.56 
 
 
584 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.59 
 
 
818 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  27.91 
 
 
574 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 
581 aa  110  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.5 
 
 
574 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  24.87 
 
 
925 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  27.66 
 
 
574 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  24.15 
 
 
653 aa  104  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  25.45 
 
 
656 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  25.45 
 
 
656 aa  100  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.42 
 
 
590 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 
590 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  21.51 
 
 
592 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  21.51 
 
 
592 aa  93.2  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  20.3 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.76 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.88 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.44 
 
 
655 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  25 
 
 
720 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  27.27 
 
 
672 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  23.46 
 
 
588 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.93 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.19 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  23.1 
 
 
619 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  25.56 
 
 
637 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.03 
 
 
577 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.93 
 
 
610 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.74 
 
 
610 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.49 
 
 
612 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.48 
 
 
610 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.48 
 
 
610 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  19.34 
 
 
585 aa  57.4  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.48 
 
 
610 aa  57.4  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  21.94 
 
 
612 aa  57.4  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  26.03 
 
 
562 aa  57  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.55 
 
 
577 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  24.89 
 
 
601 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.54 
 
 
580 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  28.78 
 
 
716 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  26.52 
 
 
545 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.05 
 
 
577 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  27.46 
 
 
546 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.23 
 
 
601 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  23.4 
 
 
629 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  23.33 
 
 
631 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  26.33 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.73 
 
 
580 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  23.82 
 
 
842 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.73 
 
 
615 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  26.37 
 
 
616 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.74 
 
 
615 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  20.3 
 
 
612 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  21.88 
 
 
633 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.08 
 
 
618 aa  51.2  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  24.37 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.47 
 
 
582 aa  50.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  23.66 
 
 
602 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>