183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08950  nuclease  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  47.22 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  48.84 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  41.45 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  44.44 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  40 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.96 
 
 		 138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.35 
 
 		 148 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  41.98 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  41.01 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  40 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  40.44 
 
 		 157 aa  104  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  42.38 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  37.32 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  41.01 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  39.87 
 
 		 187 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.1 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.3 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  41.03 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  40.6 
 
 		 153 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  44.29 
 
 		 187 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  37.69 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  42.42 
 
 		 196 aa  98.6  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  40.6 
 
 		 153 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  40 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  39.1 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.09 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  36.55 
 
 		 244 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  43.18 
 
 		 153 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  35.88 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  40.69 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  37.4 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 158 aa  92.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 221 aa  91.3  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  40.62 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  34.31 
 
 		 228 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  37.76 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  39.22 
 
 		 180 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  42.34 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.51 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  37.04 
 
 		 171 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.1 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.16 
 
 		 162 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  35.29 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  42.65 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.63 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  35.29 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  36.03 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  37.59 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.21 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.59 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  38.52 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  39.31 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.09 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  40.65 
 
 		 388 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.09 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  37.88 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  34.01 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.78 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.72 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  30 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  37.16 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.75 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  37.41 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  38.69 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  40.31 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.71 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.66 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  30.83 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  36.03 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  37.06 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  36.03 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  34.64 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.58 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  36.84 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  26.9 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.85 
 
 		 266 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.52 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.83 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.83 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.66 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.4 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  31.84 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.37 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.34 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.8 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  30.54 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  27.63 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.53 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.92 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.94 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>