229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  100 
 
 
423 aa  864  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  59.85 
 
 
416 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  59.85 
 
 
416 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  59.61 
 
 
416 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  59.9 
 
 
430 aa  504  1e-142  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.46891e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  59.9 
 
 
430 aa  505  1e-142  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  59.2 
 
 
431 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  59.65 
 
 
430 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  56.53 
 
 
428 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  55.32 
 
 
416 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  47.96 
 
 
416 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  47.72 
 
 
416 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05785e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  47.74 
 
 
417 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  47.62 
 
 
418 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  47.86 
 
 
418 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  46.76 
 
 
417 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  46.9 
 
 
418 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  46.36 
 
 
417 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  46.34 
 
 
423 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  45.87 
 
 
417 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  47.38 
 
 
417 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  46.14 
 
 
422 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  47.45 
 
 
422 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  47.2 
 
 
424 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  46.79 
 
 
415 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  48.89 
 
 
429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  44.94 
 
 
418 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  46.3 
 
 
405 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  48.4 
 
 
429 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  47.15 
 
 
395 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  45.97 
 
 
422 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  48.4 
 
 
429 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  46.8 
 
 
428 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  46.25 
 
 
427 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  45.45 
 
 
412 aa  362  7e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  48.15 
 
 
429 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  45.45 
 
 
412 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  44.61 
 
 
418 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  45.08 
 
 
421 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  47.2 
 
 
415 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  45.22 
 
 
412 aa  358  1e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  45.61 
 
 
421 aa  357  3e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  45.37 
 
 
421 aa  356  3e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  44.42 
 
 
419 aa  357  3e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  45.25 
 
 
427 aa  357  3e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  44.98 
 
 
412 aa  356  4e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  45.32 
 
 
422 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  45.58 
 
 
410 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  43.3 
 
 
424 aa  352  9e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  41.51 
 
 
416 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  43 
 
 
421 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  44.24 
 
 
422 aa  343  3e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  44.33 
 
 
426 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  45.85 
 
 
421 aa  340  3e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  43.71 
 
 
416 aa  339  6e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  44.06 
 
 
418 aa  337  2e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  41.41 
 
 
420 aa  336  4e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  44.72 
 
 
433 aa  335  8e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  43.32 
 
 
418 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  42.26 
 
 
433 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  3.30448e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  41.28 
 
 
433 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  43.17 
 
 
420 aa  328  1e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  43.94 
 
 
416 aa  327  2e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  8.11517e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  41.77 
 
 
433 aa  326  4e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  42.01 
 
 
429 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  44.06 
 
 
412 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  42.92 
 
 
417 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  41.8 
 
 
420 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  42.69 
 
 
417 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  42.62 
 
 
418 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.53 
 
 
417 aa  313  4e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  43.14 
 
 
409 aa  313  4e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  40.56 
 
 
426 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  40.71 
 
 
411 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.72 
 
 
409 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  43.81 
 
 
429 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  44.04 
 
 
427 aa  308  1e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  40.09 
 
 
439 aa  308  1e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  39.51 
 
 
413 aa  308  2e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  44.04 
 
 
423 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  40.65 
 
 
431 aa  306  4e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  41.75 
 
 
417 aa  306  5e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  44.04 
 
 
423 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  39.56 
 
 
427 aa  304  2e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  40.42 
 
 
431 aa  303  3e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  41.13 
 
 
408 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  41.09 
 
 
410 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  40.66 
 
 
408 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  40.56 
 
 
410 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  40.86 
 
 
410 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  41.28 
 
 
417 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  38.31 
 
 
460 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  42.34 
 
 
416 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40 
 
 
440 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  37.63 
 
 
463 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  39.53 
 
 
440 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  39.25 
 
 
447 aa  287  3e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  37.97 
 
 
440 aa  287  3e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  40.62 
 
 
416 aa  284  3e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17320  outer membrane porin  40.15 
 
 
402 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>