More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  100 
 
 
325 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  67.45 
 
 
341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  67.25 
 
 
342 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  68.22 
 
 
337 aa  427  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  65.17 
 
 
342 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  64.48 
 
 
342 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
332 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  63.96 
 
 
333 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  63.66 
 
 
333 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  63.36 
 
 
333 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  65.71 
 
 
335 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  42.66 
 
 
297 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  43.23 
 
 
295 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  39.82 
 
 
311 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  37.69 
 
 
322 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  40.82 
 
 
290 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  37.18 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  38.17 
 
 
297 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40.13 
 
 
323 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.31 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.28 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  52.57 
 
 
278 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50.26 
 
 
270 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.16 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  37.68 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  37.68 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43.03 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  36.56 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  59.59 
 
 
265 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  59.46 
 
 
260 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
277 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
281 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  41.37 
 
 
286 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  38.05 
 
 
280 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.84 
 
 
285 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  60.74 
 
 
283 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  37.78 
 
 
277 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  37.78 
 
 
277 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  37.46 
 
 
277 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.55 
 
 
282 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.69 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  37.54 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  36.13 
 
 
381 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  39.08 
 
 
280 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  38.31 
 
 
324 aa  165  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  37.26 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  33.43 
 
 
415 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  39.76 
 
 
284 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  32.94 
 
 
417 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  36.89 
 
 
394 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  50.32 
 
 
423 aa  156  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.25 
 
 
269 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  38.06 
 
 
263 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  46.52 
 
 
267 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  44.69 
 
 
474 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  36.61 
 
 
293 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  44.81 
 
 
455 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  44.81 
 
 
468 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  37.69 
 
 
273 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  37.18 
 
 
273 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  45.03 
 
 
267 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  44.39 
 
 
471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.5 
 
 
442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  34.95 
 
 
352 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  41.98 
 
 
341 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  35.43 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  35.12 
 
 
243 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  37.63 
 
 
322 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  45.9 
 
 
391 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
314 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  43.72 
 
 
260 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  57.72 
 
 
258 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.1 
 
 
367 aa  142  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  58.97 
 
 
382 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  38.44 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  35.84 
 
 
331 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  55.65 
 
 
259 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50.38 
 
 
246 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  42.39 
 
 
394 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  56.91 
 
 
283 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  35.48 
 
 
259 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  60 
 
 
421 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  49.32 
 
 
314 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  60 
 
 
419 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
195 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
194 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  57.76 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
398 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  40.18 
 
 
315 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  37.29 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  58.93 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
242 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
242 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
211 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  32.12 
 
 
409 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
211 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.59 
 
 
211 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>