More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  100 
 
 
271 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  81.55 
 
 
271 aa  460  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  79.7 
 
 
271 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  80.07 
 
 
271 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  76.75 
 
 
613 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  76.38 
 
 
610 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  74.91 
 
 
269 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  72.69 
 
 
269 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  72.69 
 
 
269 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  71.85 
 
 
271 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  73.06 
 
 
269 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  50.75 
 
 
276 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  47.62 
 
 
276 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  44.85 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  45.35 
 
 
273 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 
272 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  34.85 
 
 
258 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
281 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  31.32 
 
 
286 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
288 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
281 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  35.86 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  34.41 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.56 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.45 
 
 
280 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  33.84 
 
 
285 aa  131  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  29.78 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 
281 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  33.09 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  32.12 
 
 
285 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  34.46 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  32.67 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  32.67 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  34.83 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  29.96 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  29.54 
 
 
291 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  31.23 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  31.27 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  27.84 
 
 
296 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.13 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  30.55 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.71 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  28.62 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  27.87 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.87 
 
 
277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 
285 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  28.89 
 
 
277 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  28.89 
 
 
277 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  28.89 
 
 
277 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  27.87 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  28.28 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  28.84 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  27.87 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  27.87 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  31.41 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  29.24 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  33.71 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  27.46 
 
 
277 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  27.08 
 
 
321 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  31.41 
 
 
284 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
301 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 
366 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  27.96 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  31.56 
 
 
283 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  32.62 
 
 
284 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  27.46 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  35.44 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  27.46 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  29.96 
 
 
287 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 
306 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  32.04 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  30.92 
 
 
321 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
298 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
312 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  29.84 
 
 
297 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 
305 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 
321 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1559  rhodanese domain-containing protein  26.84 
 
 
389 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  29.63 
 
 
277 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  29.63 
 
 
277 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  34.78 
 
 
290 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  30.51 
 
 
281 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  26.64 
 
 
277 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.98 
 
 
299 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  34.84 
 
 
284 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  29.55 
 
 
272 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  31.87 
 
 
307 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
289 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>