More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  83.13 
 
 
249 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  83.87 
 
 
249 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  83.13 
 
 
249 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  79.03 
 
 
249 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  78.63 
 
 
249 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  77.42 
 
 
249 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  79.03 
 
 
249 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  78.63 
 
 
249 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  78.63 
 
 
249 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  73.64 
 
 
221 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  42.58 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
267 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
267 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
267 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 
267 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  41.41 
 
 
261 aa  191  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  43.46 
 
 
261 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  43.46 
 
 
261 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  43.46 
 
 
261 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  40.71 
 
 
261 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 
261 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  41.96 
 
 
267 aa  185  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  41.15 
 
 
295 aa  185  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
258 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  36.76 
 
 
259 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  41.57 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  39.53 
 
 
284 aa  178  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  44.08 
 
 
268 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  38.26 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  41.8 
 
 
256 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  38.65 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  39.53 
 
 
260 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  35.8 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  39.15 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  40.3 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  36.96 
 
 
256 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
257 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  37.85 
 
 
260 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  39.37 
 
 
254 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  34.4 
 
 
259 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.66 
 
 
263 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  35.6 
 
 
263 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  36.84 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
257 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  33.94 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  31.56 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  31.69 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  26.14 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  32 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.19 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.25 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  31.33 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.73 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  32.46 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  33.03 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.1 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  26.47 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  29.27 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.52 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3434  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>