More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_06940  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0712  ribosomal protein L11 methyltransferase  84.59 
 
 
292 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  84.93 
 
 
294 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  84.59 
 
 
294 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4402  ribosomal protein L11 methyltransferase  78.42 
 
 
292 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4862  ribosomal protein L11 methyltransferase  77.4 
 
 
292 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4871  ribosomal protein L11 methyltransferase  77.05 
 
 
292 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4608  ribosomal protein L11 methyltransferase  77.05 
 
 
292 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4693  ribosomal protein L11 methyltransferase  77.05 
 
 
292 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4818  ribosomal protein L11 methyltransferase  76.71 
 
 
292 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.983059  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0617  ribosomal protein L11 methyltransferase  75.68 
 
 
292 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00809563  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  59.46 
 
 
293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.5 
 
 
293 aa  340  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.5 
 
 
293 aa  340  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.5 
 
 
306 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2983  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.25 
 
 
296 aa  338  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.599101  normal  0.251528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.77 
 
 
295 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
295 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.14 
 
 
295 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.29 
 
 
295 aa  331  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  59.66 
 
 
299 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.78 
 
 
296 aa  330  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3446  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.77 
 
 
298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0395  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  325  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.1 
 
 
293 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.08 
 
 
292 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3938  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.1 
 
 
293 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000797733  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.86 
 
 
294 aa  322  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.08 
 
 
293 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.56 
 
 
293 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.24 
 
 
295 aa  322  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3886  ribosomal protein L11 methyltransferase  55.1 
 
 
293 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.393855  hitchhiker  0.00000257617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4079  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.76 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0139274  normal  0.0416888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0391  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.12 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000998179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0446  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.08 
 
 
293 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3224  ribosomal protein L11 methyltransferase  56.27 
 
 
295 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.105508  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.88 
 
 
295 aa  315  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0455  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.38 
 
 
293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  53.38 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0540  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.04 
 
 
293 aa  308  5.9999999999999995e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  53.98 
 
 
290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0331  ribosomal protein L11 methyltransferase  54.24 
 
 
293 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3697  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03117  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.491501  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0137973  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3451  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000753069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03068  hypothetical protein  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0092  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.02 
 
 
292 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3642  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000842217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4576  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000190936  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3681  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.77 
 
 
293 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.463059  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3554  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  298  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000257294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3574  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.77 
 
 
293 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00265065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3575  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.77 
 
 
293 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.12838  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03936  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.88 
 
 
292 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3646  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.43 
 
 
293 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.135295  decreased coverage  0.000138763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3743  ribosomal protein L11 methyltransferase  57.09 
 
 
293 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1050  ribosomal protein L11 methyltransferase  51.54 
 
 
292 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00582001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.96 
 
 
294 aa  286  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.84 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2751  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.71 
 
 
304 aa  255  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1047  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.49 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.69 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.36 
 
 
300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.83 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  51.02 
 
 
294 aa  243  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.36 
 
 
300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.36 
 
 
300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.36 
 
 
300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.36 
 
 
300 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.33 
 
 
300 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0527  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.17 
 
 
289 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.03 
 
 
300 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0503  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.52 
 
 
289 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
302 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.68 
 
 
307 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.31 
 
 
296 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.15 
 
 
297 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.67 
 
 
300 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.67 
 
 
308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.18 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  46.26 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  46.98 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03000  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.28 
 
 
301 aa  232  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.82 
 
 
298 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>