More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  100 
 
 
336 aa  675    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  51.34 
 
 
346 aa  371  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  50.3 
 
 
346 aa  338  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.96 
 
 
346 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.73 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  46.13 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.54 
 
 
343 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.54 
 
 
343 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  46.13 
 
 
343 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  45.54 
 
 
343 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.54 
 
 
343 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  46.13 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  45.24 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  44.94 
 
 
343 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  45.59 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  45.05 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  46.15 
 
 
346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  47.65 
 
 
348 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  45.75 
 
 
348 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.56 
 
 
350 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  49.56 
 
 
350 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  45.45 
 
 
348 aa  295  9e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  48.05 
 
 
350 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  46.63 
 
 
349 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.56 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  47.18 
 
 
346 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  46.31 
 
 
350 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.56 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  49.56 
 
 
350 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.85 
 
 
367 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.85 
 
 
367 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  46.88 
 
 
346 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  44.15 
 
 
349 aa  288  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  46.88 
 
 
346 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  46.88 
 
 
346 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
349 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
349 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  44.71 
 
 
349 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  44.84 
 
 
346 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  46.29 
 
 
359 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  46.29 
 
 
359 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  46.29 
 
 
346 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  46.29 
 
 
346 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  46.29 
 
 
346 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  45.99 
 
 
346 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  46.59 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  44.09 
 
 
361 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  45.99 
 
 
359 aa  286  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  45.99 
 
 
346 aa  285  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  42.64 
 
 
344 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  45.99 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  46.41 
 
 
346 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  43.02 
 
 
374 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  43.35 
 
 
357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  42.69 
 
 
349 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  41.59 
 
 
350 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  47.35 
 
 
350 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  44.05 
 
 
357 aa  265  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  45.72 
 
 
345 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  46.2 
 
 
349 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  47.65 
 
 
350 aa  258  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  39.41 
 
 
348 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  47.2 
 
 
341 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  43.45 
 
 
360 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  48.83 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  46.85 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  46.85 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  46.9 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  41.81 
 
 
355 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  45.32 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  43.28 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  42.77 
 
 
349 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  38.57 
 
 
360 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  42.06 
 
 
347 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  40.54 
 
 
358 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  42.06 
 
 
350 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  40.94 
 
 
363 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3804  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 
353 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 
358 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 
358 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  41.23 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  36.84 
 
 
336 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  38.99 
 
 
347 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  41.4 
 
 
383 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  42.65 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  40.71 
 
 
345 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0227  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 
346 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000151204  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  35.82 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  38.51 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 
358 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1980  oxidoreductase domain-containing protein  39.21 
 
 
347 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.315643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 
337 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2993  oxidoreductase domain protein  40.47 
 
 
354 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00237392  hitchhiker  0.000625916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1832  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.63 
 
 
353 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000457819  normal  0.338324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3425  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.33 
 
 
353 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3413  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  33.93 
 
 
353 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0020549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3112  oxidoreductase  34.33 
 
 
353 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3437  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.03 
 
 
353 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
341 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3184  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.03 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>