15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  517  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  56.15 
 
 
247 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  56.59 
 
 
272 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  49.39 
 
 
268 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  54.76 
 
 
267 aa  211  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  47.84 
 
 
263 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  51.01 
 
 
273 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  47.2 
 
 
235 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  48.29 
 
 
253 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  51.05 
 
 
253 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  46.58 
 
 
254 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  46.6 
 
 
264 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  49.35 
 
 
196 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1614  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0254992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>