More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
323 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  75.16 
 
 
314 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  74.68 
 
 
314 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  62.99 
 
 
315 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  62.99 
 
 
315 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  62.99 
 
 
315 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  61.36 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  58.52 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  63.96 
 
 
317 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
317 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  58.2 
 
 
312 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  58.15 
 
 
313 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  57.51 
 
 
313 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  57.51 
 
 
313 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  57.51 
 
 
313 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  58.61 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  58.61 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  62.21 
 
 
322 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  56.59 
 
 
312 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  58.31 
 
 
313 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  61.26 
 
 
332 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  60.6 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  52.98 
 
 
334 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
316 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  58.06 
 
 
316 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  57.74 
 
 
316 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  57.76 
 
 
313 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  58.42 
 
 
313 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  57.43 
 
 
313 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  56.67 
 
 
317 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  51.27 
 
 
315 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  50.63 
 
 
331 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
336 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
336 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
336 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
336 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
354 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  49.05 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  49.05 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
331 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
336 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
315 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
315 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  50.8 
 
 
332 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 
430 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
323 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
322 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 
311 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
322 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  50 
 
 
431 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
318 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 
308 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
322 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  49.03 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  48.73 
 
 
355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
329 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
329 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  48.55 
 
 
327 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
327 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
312 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
310 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
310 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
310 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
352 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
310 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 
308 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
315 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
328 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
328 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
328 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  44.84 
 
 
323 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
324 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  43.3 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
303 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
320 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 
293 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  37.8 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
349 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
296 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
312 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>