More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  100 
 
 
249 aa  470  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
252 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 
273 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  46.25 
 
 
275 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.86 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.86 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  42.15 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  39.67 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  42.73 
 
 
257 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
266 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  36.44 
 
 
261 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 
264 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.48 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
284 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 
282 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
261 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
261 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 
270 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
275 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
292 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
260 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 
261 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  40.08 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
270 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  35.29 
 
 
360 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.58 
 
 
270 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
273 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
273 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.84 
 
 
262 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.84 
 
 
262 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  37.25 
 
 
262 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  37.2 
 
 
272 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  36.84 
 
 
262 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 
281 aa  148  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  38.96 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.33 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.92 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.92 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.44 
 
 
262 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.44 
 
 
262 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1683  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
269 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.77 
 
 
264 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  37.11 
 
 
262 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.96 
 
 
256 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  33.06 
 
 
249 aa  144  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.11 
 
 
272 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.95 
 
 
272 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 
272 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
310 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 
254 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  38.82 
 
 
265 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  40.85 
 
 
272 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  40.85 
 
 
272 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  36.73 
 
 
242 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
275 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
274 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  35.95 
 
 
245 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.18 
 
 
271 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 
245 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  38.94 
 
 
261 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  40.69 
 
 
255 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  36.12 
 
 
350 aa  142  5e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 
246 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
260 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
240 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
240 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
240 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
240 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
240 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
267 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3163  ABC transporter related  38.75 
 
 
272 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.816893  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  36.29 
 
 
333 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
269 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  35.92 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  37.97 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
284 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  35.71 
 
 
363 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  35.71 
 
 
363 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2905  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.19 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217934  normal  0.0141495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0670  ABC transporter related  35.48 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  38.46 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3138  ABC transporter related  40.95 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  38.26 
 
 
244 aa  138  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  36.1 
 
 
263 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0684  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
253 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0640  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
253 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 
244 aa  138  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  37.66 
 
 
252 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>