169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  50.31 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  48.45 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  49.69 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  44.51 
 
 		 183 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  44.51 
 
 		 183 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  43.96 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  43.96 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  43.96 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  50.62 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  46.55 
 
 		 182 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  41.76 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  48.45 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  45.6 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  46.58 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  46.58 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  45.96 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  45.96 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  46.58 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  45.68 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  45.68 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  45.34 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  45.34 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  45.96 
 
 		 182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  42.86 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  42.7 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  44.05 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  43.45 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  39.66 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  42.24 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  41.21 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  40.66 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  40.11 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  40.11 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  43.48 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  43.83 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  40.49 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  40.49 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  41.1 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  41.1 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  46.3 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  40.61 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  39.64 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  44.24 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  40.52 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  40.24 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  33.9 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  40.85 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  39.56 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  41.57 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  39.36 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  36.81 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  39.13 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  39.39 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  38.18 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  36.96 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  36.59 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  35.87 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  40.53 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  36.63 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  38.95 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  39.18 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  36.14 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2466  nitroreductase  39.18 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.294476 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  37.3 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  38.01 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0809  hypothetical protein  38.6 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  36.53 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0371  nitroreductase  38.27 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.408673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  36.63 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  28.42 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  37.84 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  38.27 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  35.33 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  36.57 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  32.78 
 
 		 191 aa  94.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  30.3 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  36.14 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0695  nitroreductase  35.58 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264494  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01930  nitroreductase  36.87 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  33.33 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  34.34 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  34.52 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  32.95 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  31.75 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  34.09 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  33.73 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  31.52 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  34.09 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  34.09 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>