More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  61.44 
 
 
317 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  62.5 
 
 
314 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  60.9 
 
 
314 aa  363  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  61.18 
 
 
319 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  60.87 
 
 
319 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  61.37 
 
 
318 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  55.73 
 
 
306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  55.73 
 
 
306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  55.73 
 
 
306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  55.73 
 
 
306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  55.73 
 
 
306 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.76 
 
 
323 aa  335  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  54.63 
 
 
306 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  54.63 
 
 
306 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  54.31 
 
 
306 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  54.31 
 
 
306 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  54.31 
 
 
306 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  54.31 
 
 
306 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  54.31 
 
 
306 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  54.31 
 
 
306 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  53.99 
 
 
306 aa  328  9e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  55.38 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  56.15 
 
 
316 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  53.87 
 
 
320 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.65 
 
 
324 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  44.9 
 
 
341 aa  275  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  44.9 
 
 
313 aa  275  9e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  49.53 
 
 
319 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  43.35 
 
 
315 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  42.04 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  44.79 
 
 
315 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  47.73 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  40.36 
 
 
324 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  41.67 
 
 
320 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  44.69 
 
 
297 aa  229  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
315 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  44.23 
 
 
313 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  44.41 
 
 
295 aa  226  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  40.91 
 
 
327 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.63 
 
 
313 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  43.51 
 
 
296 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  43.71 
 
 
316 aa  222  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.52 
 
 
323 aa  222  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  45.37 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  45.34 
 
 
310 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  45.34 
 
 
310 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.42 
 
 
315 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  44.22 
 
 
311 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.54 
 
 
313 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.19 
 
 
324 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  41.46 
 
 
326 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.77 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  41.43 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.26 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  44.16 
 
 
321 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  40.13 
 
 
287 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  39.81 
 
 
326 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
326 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.73 
 
 
319 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.56 
 
 
316 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  43.49 
 
 
304 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  41.99 
 
 
315 aa  208  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  42.09 
 
 
313 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  40.19 
 
 
307 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  43.34 
 
 
318 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  39.26 
 
 
335 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  37.88 
 
 
382 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.25 
 
 
347 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  42.55 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  37.42 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  37.22 
 
 
375 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.69 
 
 
314 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
379 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  36.84 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.85 
 
 
289 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.16 
 
 
331 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.64 
 
 
334 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  39.5 
 
 
377 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
381 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  38.51 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 
375 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  36.57 
 
 
376 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  36.69 
 
 
379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  36.69 
 
 
379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  36.69 
 
 
379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  36.69 
 
 
379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  36.69 
 
 
379 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  36.77 
 
 
377 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  36.57 
 
 
376 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  36.57 
 
 
376 aa  188  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  43.08 
 
 
318 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>