More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  100 
 
 		 383 aa  765    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  70.57 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  66.85 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  66.85 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  66.57 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.58 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  66.58 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  66.58 
 
 		 384 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.03 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  63.59 
 
 		 386 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  65.03 
 
 		 385 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  62.57 
 
 		 387 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  59.5 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  54.86 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  55.86 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  53.59 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  54.05 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  51.44 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  53.44 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  53.44 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  53.78 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2557  secretion protein HlyD  52.51 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  51.5 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  55.94 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.48 
 
 		 395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  51.61 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.89 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  49.21 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  51.7 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  51.33 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  55.13 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  51.32 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  52.49 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  52.5 
 
 		 381 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.26 
 
 		 396 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.11 
 
 		 410 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  51.48 
 
 		 412 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.64 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  49.35 
 
 		 409 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.27 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  49.35 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  50 
 
 		 425 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  48.65 
 
 		 386 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  51.63 
 
 		 423 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  49.09 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  49.09 
 
 		 409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  50.4 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.21 
 
 		 411 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 381 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  50.26 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  50.26 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  53.1 
 
 		 384 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  49.18 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  48.66 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  48.19 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  48.19 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  48.19 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  49.31 
 
 		 418 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  49.31 
 
 		 418 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  48.66 
 
 		 412 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  48.19 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  48.19 
 
 		 397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  49.31 
 
 		 418 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  49.05 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  49.05 
 
 		 382 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  49.18 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  49.05 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  53.39 
 
 		 409 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  51.78 
 
 		 386 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  51.51 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.79 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  52.34 
 
 		 378 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  48.34 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  48.34 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  48.34 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  47.63 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  48.23 
 
 		 382 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  49.44 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  49.72 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  45.65 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  49.72 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  48.4 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  48.07 
 
 		 385 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  47.87 
 
 		 420 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  47.87 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.98 
 
 		 405 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  47.87 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  47.87 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>