36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  56.16 
 
 
153 aa  177  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  51.01 
 
 
169 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  47.62 
 
 
149 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  41.06 
 
 
165 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  40.4 
 
 
155 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  38.62 
 
 
159 aa  137  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  40.43 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  43.07 
 
 
155 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  43.07 
 
 
155 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  42.55 
 
 
158 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  39.73 
 
 
170 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  46.51 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  44.19 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  37.67 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  40.56 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  46.15 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  45.38 
 
 
156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  39.31 
 
 
153 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  35.97 
 
 
155 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  44.03 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  37.09 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  38.13 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  39.46 
 
 
158 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  41.3 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  38.41 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  42.34 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  45.16 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  45.16 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  37.14 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  36.62 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  43.09 
 
 
156 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  41.27 
 
 
147 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>