284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  74.86 
 
 		 522 aa  843    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 		 523 aa  1099    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  68.83 
 
 		 522 aa  784    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  69.35 
 
 		 524 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  72.47 
 
 		 523 aa  831    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.24 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.24 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.68 
 
 		 512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.11 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.24 
 
 		 512 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.76 
 
 		 519 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.77 
 
 		 519 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.38 
 
 		 519 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.58 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.4 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  53.2 
 
 		 519 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.32 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  52.45 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  53.32 
 
 		 519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.32 
 
 		 519 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.94 
 
 		 519 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.39 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.58 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.8 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.31 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.94 
 
 		 519 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.29 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  53.15 
 
 		 511 aa  574  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  53.01 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.95 
 
 		 512 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.67 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.1 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.66 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  54.36 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.91 
 
 		 506 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.53 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.53 
 
 		 506 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.62 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.56 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.25 
 
 		 518 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.59 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.43 
 
 		 489 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.77 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.05 
 
 		 487 aa  501  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  49.05 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.56 
 
 		 487 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.62 
 
 		 489 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  46.91 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.15 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.39 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.74 
 
 		 489 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.02 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  40.49 
 
 		 456 aa  360  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.4 
 
 		 461 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.96 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.96 
 
 		 459 aa  349  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.6 
 
 		 459 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.43 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.1 
 
 		 458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.45 
 
 		 459 aa  334  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.42 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.74 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.58 
 
 		 463 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  38.02 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.77 
 
 		 460 aa  326  7e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.18 
 
 		 461 aa  325  9e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.29 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.53 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  38.39 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  37.55 
 
 		 477 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.65 
 
 		 455 aa  302  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  35.02 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  35.6 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  34.58 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  35.84 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  36.54 
 
 		 490 aa  286  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  35.45 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  35.99 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  34.6 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  35.92 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  34.18 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  34.18 
 
 		 462 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  32.47 
 
 		 451 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  33.48 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  33.4 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  33.33 
 
 		 451 aa  242  9e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  32.08 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  33.12 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  33.86 
 
 		 479 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  32.68 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.03 
 
 		 462 aa  237  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  32.23 
 
 		 450 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  32.09 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  29.94 
 
 		 538 aa  230  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  32.24 
 
 		 450 aa  226  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  30.26 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  32.6 
 
 		 450 aa  226  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  31.61 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  33.48 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  30.33 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>