20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  48.55 
 
 
140 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  47.06 
 
 
137 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  44.85 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  45.59 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  44.85 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  50.83 
 
 
138 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  49.17 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  42.62 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  38.76 
 
 
137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  39.53 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  42.52 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  38.76 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  40.83 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  37.8 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  37.21 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  36.23 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  37.5 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  36.51 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
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