31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  705    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  62.46 
 
 
376 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  63.3 
 
 
351 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  62.65 
 
 
351 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  66.16 
 
 
353 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  63.42 
 
 
363 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  62.94 
 
 
387 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  63.72 
 
 
357 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  63.42 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  62.11 
 
 
336 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  61.21 
 
 
375 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  43.63 
 
 
379 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  44.09 
 
 
385 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  44.67 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  43.2 
 
 
357 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  42.74 
 
 
365 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  44.44 
 
 
365 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  41.09 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  41.95 
 
 
360 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  43.11 
 
 
363 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  42.45 
 
 
385 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  41.5 
 
 
374 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  40.58 
 
 
384 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  39.77 
 
 
369 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  43.43 
 
 
399 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  38.59 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  39.78 
 
 
381 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  39.39 
 
 
381 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  33.75 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  30.77 
 
 
343 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  33.48 
 
 
340 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>