266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3383  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  75.59 
 
 
594 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00900  gluconate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
591 aa  1227    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687718  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  77.63 
 
 
592 aa  979    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  77.12 
 
 
592 aa  969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6210  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.1 
 
 
594 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1943  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  76.43 
 
 
594 aa  948    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2562  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  75.08 
 
 
594 aa  924    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0936094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.97 
 
 
592 aa  984    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2137  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  75.38 
 
 
593 aa  949    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.610724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0227  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.45 
 
 
592 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  70.46 
 
 
594 aa  853    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2015  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.2 
 
 
592 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0874518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4095  putative gluconate dehydrogenase  58.92 
 
 
594 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.44 
 
 
591 aa  781    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.809457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  75.42 
 
 
594 aa  948    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.406153  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.63 
 
 
592 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.63 
 
 
592 aa  980    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35290  gluconate dehydrogenase  88.83 
 
 
591 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685157  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.63 
 
 
592 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2565  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  74.24 
 
 
594 aa  926    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2975  gluconate dehydrogenase  88.83 
 
 
591 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  77.8 
 
 
592 aa  980    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  77.53 
 
 
592 aa  983    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3608  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.86 
 
 
589 aa  628  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0579552  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4244  putative gluconate dehydrogenase  51.16 
 
 
588 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659751  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3895  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.88 
 
 
594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.241761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33650  dehydrogenase flavoprotein subunit  45.78 
 
 
596 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4202  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.08 
 
 
590 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.494803  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5399  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.05 
 
 
586 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1314  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.33 
 
 
589 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  44.46 
 
 
591 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1598  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.83 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0439  oxidoreductase, putative  40.31 
 
 
573 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0464  oxidoreductase, putative  40.31 
 
 
573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.66 
 
 
553 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.04 
 
 
550 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.21 
 
 
755 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.34 
 
 
549 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.47 
 
 
526 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.86 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.27 
 
 
522 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  24.72 
 
 
573 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 
527 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.55 
 
 
522 aa  156  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.04 
 
 
528 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.56 
 
 
522 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.56 
 
 
522 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  27.62 
 
 
523 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.08 
 
 
561 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.51 
 
 
572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 
518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 
528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.45 
 
 
527 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.79 
 
 
563 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.78 
 
 
528 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.64 
 
 
578 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 
526 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 
553 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.23 
 
 
573 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.19 
 
 
522 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
579 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 
522 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.32 
 
 
581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.83 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 
522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
545 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  25.96 
 
 
647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 
534 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.59 
 
 
566 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.63 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.67 
 
 
579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 
523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 
556 aa  128  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  26.73 
 
 
561 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.98 
 
 
515 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.6 
 
 
578 aa  126  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 
533 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.33 
 
 
561 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 
570 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.1 
 
 
549 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 
567 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.25 
 
 
570 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.4 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.77 
 
 
573 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 
547 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  26.11 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
548 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 
582 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.83 
 
 
521 aa  118  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 
584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.19 
 
 
579 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 
573 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 
569 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  25.64 
 
 
558 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.43 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.19 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.8 
 
 
566 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  27.09 
 
 
570 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>