49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  76.76 
 
 		 238 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  77.08 
 
 		 238 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  59.27 
 
 		 248 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  59.34 
 
 		 245 aa  289  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  59.02 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.33 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.68 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.68 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.2 
 
 		 263 aa  275  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  56.02 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.38 
 
 		 245 aa  271  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  55.7 
 
 		 262 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  56.56 
 
 		 263 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  56.56 
 
 		 263 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.19 
 
 		 246 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.56 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  52.12 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.62 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.39 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.09 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  48.95 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.21 
 
 		 217 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  45.15 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  47.85 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  45.6 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  43.1 
 
 		 262 aa  141  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  34.05 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  33.62 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  39.13 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  37.11 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  35.26 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  36.26 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  34.15 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 755 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  32.31 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  28.24 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  28.81 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  24.12 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.54 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  26.47 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.29 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  28.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  28.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  28.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  28.1 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>