11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00870  lipoprotein  100 
 
 		 128 aa  246  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6303  putative lipoprotein  40.65 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0063  putative lipoprotein  43.75 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4502  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5264  lipoprotein, putative  42.61 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0279  putative lipoprotein  41.96 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.925672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72600  putative lipoprotein  38 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0116  putative lipoprotein  41.07 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0133  hypothetical protein  41.07 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5112  lipoprotein  40.18 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0131  lipoprotein  42.86 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>