More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 
297 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  66.78 
 
 
309 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  68.88 
 
 
307 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  68.88 
 
 
307 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  62.21 
 
 
313 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  64.94 
 
 
302 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  66.89 
 
 
302 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  66.55 
 
 
318 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  66.22 
 
 
302 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  61.36 
 
 
311 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  71.11 
 
 
350 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.83 
 
 
310 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  41.97 
 
 
295 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  37.22 
 
 
344 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
314 aa  216  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.37 
 
 
352 aa  213  3e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.37 
 
 
310 aa  212  6e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.54 
 
 
310 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  42.36 
 
 
313 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.72 
 
 
310 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  37.72 
 
 
328 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.72 
 
 
310 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.72 
 
 
310 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  37.72 
 
 
310 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  41.45 
 
 
293 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  36.79 
 
 
351 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.33 
 
 
321 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.54 
 
 
314 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.19 
 
 
340 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  37.38 
 
 
332 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.64 
 
 
334 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.64 
 
 
334 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  36.36 
 
 
308 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 
347 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  31.98 
 
 
346 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.56 
 
 
340 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.86 
 
 
318 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.53 
 
 
318 aa  201  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.58 
 
 
339 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.26 
 
 
339 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  33.45 
 
 
297 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  41 
 
 
329 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  34.9 
 
 
303 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  39.59 
 
 
297 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  36.01 
 
 
328 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 
321 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  34.58 
 
 
336 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.26 
 
 
282 aa  147  2e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  29.56 
 
 
362 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  41.18 
 
 
371 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 
287 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  35.06 
 
 
345 aa  141  1e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  34.85 
 
 
347 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 
301 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 
326 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  39.02 
 
 
369 aa  134  1e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.47 
 
 
333 aa  131  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  26.61 
 
 
334 aa  130  2e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  30.51 
 
 
372 aa  130  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  38.98 
 
 
356 aa  128  1e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  31.11 
 
 
294 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.92 
 
 
320 aa  121  2e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 
318 aa  120  2e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
311 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.43 
 
 
309 aa  118  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  23.1 
 
 
293 aa  117  2e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 
312 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
339 aa  116  4e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 
316 aa  115  7e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.02 
 
 
302 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.73282e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 
358 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 
300 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 
292 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  31.96 
 
 
378 aa  109  7e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.23 
 
 
292 aa  108  9e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 
345 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 
346 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 
302 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25.91 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.91 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 
332 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.71872e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.91 
 
 
316 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  24.82 
 
 
316 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.82 
 
 
316 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.87 
 
 
311 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  25 
 
 
316 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  24.17 
 
 
314 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.42 
 
 
323 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  30.24 
 
 
318 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  25.39 
 
 
317 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.13 
 
 
326 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 
300 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  23.95 
 
 
317 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  23.95 
 
 
317 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
331 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  28.83 
 
 
324 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>