More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  100 
 
 		 342 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  35.91 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  35.82 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  37.43 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  35.8 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.73 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  34.16 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  34.34 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  34.04 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  34.04 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.91 
 
 		 357 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.03 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  36.03 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  38.73 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  35.94 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  32.56 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  34.89 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  33.75 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  30.34 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  34.27 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.31 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  33.75 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  30.67 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  29.39 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  31.71 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  28.83 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 393 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  34.89 
 
 		 345 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25.3 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.6 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  32.92 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  31.18 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 352 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  30.81 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.92 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  32.49 
 
 		 358 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  28.34 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.19 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.14 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  28.36 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.54 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.26 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.38 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.12 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.23 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  22.16 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  25.99 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.13 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.96 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.29 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  28.29 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 682 aa  73.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.19 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.45 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.45 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  29.12 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>