51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9914 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_9914  kinase  100 
 
 		 175 aa  360  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  69.09 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  62.64 
 
 		 169 aa  217  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  56.21 
 
 		 169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  50.9 
 
 		 195 aa  174  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  50.31 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  53.69 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  44.31 
 
 		 190 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  50.68 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  52.35 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  44.57 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  38.42 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  39.76 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  48.15 
 
 		 65 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  46.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  29.79 
 
 		 518 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  28.66 
 
 		 504 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  28.07 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  30.84 
 
 		 520 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  28.45 
 
 		 194 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  29.5 
 
 		 518 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  25.17 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  27.96 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  25.7 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  35.29 
 
 		 533 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  25.17 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  45.45 
 
 		 508 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  51.11 
 
 		 51 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  29.1 
 
 		 422 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  45.83 
 
 		 490 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  29.55 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  31.13 
 
 		 532 aa  45.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  24.49 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  27.14 
 
 		 520 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  25.34 
 
 		 345 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  28.39 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  28.04 
 
 		 544 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  34.59 
 
 		 519 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  26.43 
 
 		 525 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  31.51 
 
 		 512 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  24.49 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  29.23 
 
 		 526 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  43.24 
 
 		 513 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  48.65 
 
 		 523 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  30.77 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  31.37 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  41.67 
 
 		 498 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>