More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9869 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  53.6 
 
 		 1047 aa  1115    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  53.7 
 
 		 1047 aa  1116    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.09 
 
 		 1070 aa  1103    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  50.81 
 
 		 1045 aa  1024    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.29 
 
 		 1077 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  51.01 
 
 		 1049 aa  1071    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  51.3 
 
 		 1048 aa  1063    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.89 
 
 		 1052 aa  1125    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  54.89 
 
 		 1049 aa  1119    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  55.21 
 
 		 1040 aa  1114    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.09 
 
 		 1070 aa  1103    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  65.7 
 
 		 1066 aa  1415    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  53.6 
 
 		 1048 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  56.42 
 
 		 1047 aa  1156    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  54.97 
 
 		 1052 aa  1145    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  55.02 
 
 		 1056 aa  1138    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  55.04 
 
 		 1039 aa  1144    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  53.9 
 
 		 1052 aa  1118    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  50.67 
 
 		 1045 aa  1067    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  49.86 
 
 		 1045 aa  1058    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  51.12 
 
 		 1045 aa  1055    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.49 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  54.09 
 
 		 1070 aa  1103    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.2 
 
 		 1077 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  51.73 
 
 		 1047 aa  1061    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.41 
 
 		 1049 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.55 
 
 		 1052 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  51.09 
 
 		 1047 aa  1082    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  52.76 
 
 		 1045 aa  1080    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.99 
 
 		 1051 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  53.77 
 
 		 1068 aa  1098    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  67.4 
 
 		 1051 aa  1454    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  67.34 
 
 		 1044 aa  1429    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  56.43 
 
 		 1055 aa  1155    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  49.54 
 
 		 1100 aa  978    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  50.46 
 
 		 1091 aa  1020    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55 
 
 		 1042 aa  1138    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.09 
 
 		 1070 aa  1103    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  51.2 
 
 		 1049 aa  1074    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  53.89 
 
 		 1060 aa  1127    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  52.46 
 
 		 1061 aa  1066    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  79.72 
 
 		 1058 aa  1680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  54.61 
 
 		 1070 aa  1100    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.49 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  74.98 
 
 		 1069 aa  1602    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  50.62 
 
 		 1045 aa  1063    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  74.13 
 
 		 1057 aa  1585    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  55.27 
 
 		 1067 aa  1143    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  52.1 
 
 		 1074 aa  1078    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  54.03 
 
 		 1056 aa  1120    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  53.7 
 
 		 1048 aa  1104    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  55.5 
 
 		 1074 aa  1207    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.84 
 
 		 1070 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  50.48 
 
 		 1045 aa  1036    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.29 
 
 		 1077 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  50 
 
 		 1046 aa  986    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1077 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  52.95 
 
 		 1054 aa  1070    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.52 
 
 		 1064 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  44.78 
 
 		 1015 aa  896    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  50.47 
 
 		 1049 aa  1070    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  62.2 
 
 		 1059 aa  1342    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.19 
 
 		 1070 aa  1105    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.96 
 
 		 1061 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.88 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  49.54 
 
 		 1094 aa  1011    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  74.18 
 
 		 1051 aa  1549    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  45.9 
 
 		 1049 aa  926    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  67.21 
 
 		 1043 aa  1457    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  56.14 
 
 		 1039 aa  1151    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.19 
 
 		 1070 aa  1103    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  68.04 
 
 		 1043 aa  1468    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  54.55 
 
 		 1042 aa  1107    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  73.83 
 
 		 1052 aa  1572    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  53.89 
 
 		 1038 aa  1104    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  73.92 
 
 		 1063 aa  1588    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.29 
 
 		 1077 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  56.05 
 
 		 1056 aa  1141    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  52.1 
 
 		 1042 aa  1112    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  50.62 
 
 		 1045 aa  1055    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  74.3 
 
 		 1043 aa  1560    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  81.16 
 
 		 1058 aa  1706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  53.26 
 
 		 1039 aa  1105    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  51.05 
 
 		 1047 aa  1093    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  73.67 
 
 		 1060 aa  1569    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  78.14 
 
 		 1065 aa  1671    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  50.39 
 
 		 1045 aa  1009    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.13 
 
 		 1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  73.72 
 
 		 1060 aa  1550    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  67.47 
 
 		 1059 aa  1461    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  55.37 
 
 		 1056 aa  1144    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  55.24 
 
 		 1063 aa  1144    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  51.57 
 
 		 1048 aa  1046    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  55.57 
 
 		 1055 aa  1162    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  53.46 
 
 		 1044 aa  1081    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  54.99 
 
 		 1044 aa  1115    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  54.13 
 
 		 1047 aa  1127    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.13 
 
 		 1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  53.77 
 
 		 1068 aa  1098    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  55.03 
 
 		 1068 aa  1129    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
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