290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9806 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  67.71 
 
 		 237 aa  295  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  57.51 
 
 		 237 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  29.18 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  29.18 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  27.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  32.31 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.7 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  30.06 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  24.38 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  28.5 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.78 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.56 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30.41 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  27.59 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  30.4 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6913  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  29.85 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.74 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  24.88 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  28.93 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.71 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.71 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.71 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.28 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.65 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.28 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.23 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  27.89 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.28 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.28 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  29.92 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  23.5 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  26.36 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  29.92 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  29.27 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.63 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.73 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.91 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  28.35 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1557  hypothetical protein  45.28 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.92 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29.29 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>