95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9541 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.97 
 
 		 2077 aa  893    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.03 
 
 		 1932 aa  712    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  36.92 
 
 		 1642 aa  880    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34.27 
 
 		 1649 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  77.74 
 
 		 1748 aa  2665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  82.77 
 
 		 1702 aa  2859    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.97 
 
 		 1575 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  78.83 
 
 		 1417 aa  2223    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  76.69 
 
 		 1697 aa  2593    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  55.01 
 
 		 1693 aa  1771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  81.52 
 
 		 1516 aa  2505    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  34.92 
 
 		 1606 aa  765    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  82.66 
 
 		 470 aa  773    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  77.76 
 
 		 1700 aa  2656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  71.45 
 
 		 1703 aa  2461    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.56 
 
 		 1706 aa  730    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.19 
 
 		 1726 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  82.67 
 
 		 1697 aa  2882    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  100 
 
 		 1701 aa  3454    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.86 
 
 		 1934 aa  696    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.81 
 
 		 2098 aa  773    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  80.44 
 
 		 1211 aa  1910    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  36.59 
 
 		 1669 aa  869    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.97 
 
 		 1669 aa  860    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 1594 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  31.08 
 
 		 1956 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.81 
 
 		 1925 aa  579  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  27.22 
 
 		 2570 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.32 
 
 		 2117 aa  540  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 1674 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.46 
 
 		 2274 aa  485  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.94 
 
 		 1722 aa  452  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.28 
 
 		 976 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.75 
 
 		 2005 aa  399  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  60.22 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  30.41 
 
 		 763 aa  221  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 761 aa  216  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  64.67 
 
 		 246 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  29.47 
 
 		 766 aa  195  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 577 aa  161  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  32.45 
 
 		 526 aa  125  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7033  hypothetical protein  59.3 
 
 		 97 aa  94.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  24.3 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  30 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  28.9 
 
 		 339 aa  82  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  29.67 
 
 		 341 aa  80.1  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  26.97 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  37.93 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.8 
 
 		 1379 aa  63.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 1116 aa  57  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 1046 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.35 
 
 		 933 aa  54.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  34.94 
 
 		 950 aa  53.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 968 aa  53.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.19 
 
 		 1147 aa  52.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  34.53 
 
 		 466 aa  53.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  32.77 
 
 		 900 aa  52.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  24.89 
 
 		 503 aa  52.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 986 aa  52.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.36 
 
 		 477 aa  52.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.87 
 
 		 1028 aa  52.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  29.63 
 
 		 958 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  28.67 
 
 		 468 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  33.73 
 
 		 953 aa  51.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  38.57 
 
 		 889 aa  51.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 958 aa  51.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  32.05 
 
 		 910 aa  50.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  37.33 
 
 		 922 aa  50.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.69 
 
 		 423 aa  49.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.68 
 
 		 969 aa  49.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 945 aa  48.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  23.44 
 
 		 941 aa  48.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  29.69 
 
 		 928 aa  48.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  28.57 
 
 		 924 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  28.73 
 
 		 318 aa  48.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.36 
 
 		 557 aa  47.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.27 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.27 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.66 
 
 		 1160 aa  47.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  31.03 
 
 		 957 aa  47.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  32.09 
 
 		 805 aa  47.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  30.53 
 
 		 541 aa  47  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.82 
 
 		 1095 aa  46.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 877 aa  47  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  32.26 
 
 		 801 aa  46.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1177 aa  46.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.49 
 
 		 952 aa  46.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.79 
 
 		 949 aa  46.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 		 940 aa  45.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  31.46 
 
 		 572 aa  45.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  32.1 
 
 		 948 aa  45.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  21.74 
 
 		 442 aa  45.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.65 
 
 		 937 aa  45.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 484 aa  45.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>