42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9182 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  179  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  73.17 
 
 		 111 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  68.24 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  69.51 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  69.88 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  63.64 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  54.93 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  54.93 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  47.95 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  45.21 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  41.67 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  45.07 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  44.29 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  52.54 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  37.33 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  37.33 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  51.02 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  42.47 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  48.15 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  48.15 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  41.43 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  40.54 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  43.24 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  42.86 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  45.71 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  38.36 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  32 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  40.58 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0231  WGR domain-containing protein  36.36 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  34.78 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1822 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  42.86 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0289  WGR domain protein  35.06 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3038  hypothetical protein  32.86 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  31.25 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2748  WGR domain-containing protein  38.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.393402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1085  hypothetical protein  38.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1569  WGR domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.380213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  40 
 
 		 1314 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  34.48 
 
 		 1838 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>