205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8214 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  30.73 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  31.28 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  30.37 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  32 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  30.67 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  27.81 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.27 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  30.06 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  26.77 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3901  virC1 gene, ATPase  29.15 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691953  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  27.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.59 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.6 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  25.62 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  28.16 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  29.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  25.62 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6913  ATPase-like protein involved in chromosome partitioning  32.53 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  28.27 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  28.9 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.86 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.66 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  51.06 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.65 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.52 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.66 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0443  ParA-like protein  28.93 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.190603  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  23.29 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.21 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.32 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.21 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  25.85 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  28.5 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.21 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.21 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.27 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.77 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6226  chromosome partitioning ATPase  50 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.307356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  27.48 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.34 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  23.66 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.98 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.7 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.81 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  26.98 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.21 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.42 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  24.14 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.21 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  24.54 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.74 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  25.29 
 
 		 372 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  22.5 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.2 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.68 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  25.29 
 
 		 364 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.35 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  44.68 
 
 		 905 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2197  chromosome partitioning ATPase  48.72 
 
 		 354 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.04216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>