53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8137 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8137  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  292  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9559  hypothetical protein  44.53 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.766042  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4722  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  44.44 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4756  hypothetical protein  43.7 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6423  hypothetical protein  34.96 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  34.53 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  36.36 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  36.04 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  39.05 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.19 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  39.39 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  41.11 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000366609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  41.11 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1777  putative solute/DNA competence effector  41.11 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205752  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  38.38 
 
 		 228 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  38.38 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  37.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  37.14 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000511987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  38.38 
 
 		 227 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  37.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  37.37 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  35.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  33.63 
 
 		 208 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000947436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  38.95 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000695377  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  36.79 
 
 		 203 aa  48.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  38.89 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  38.89 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2561  putative solute/DNA competence effector  38.89 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  normal  0.0763092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  38.89 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2132  putative solute/DNA competence effector  41.18 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000562228  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  39.29 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  39.29 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  36 
 
 		 213 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  36.19 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  37.5 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  40 
 
 		 215 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  32.18 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  34.88 
 
 		 211 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  29.06 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  31.19 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>