More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7675 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7675  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  28.12 
 
 
390 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.05 
 
 
629 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  27.18 
 
 
385 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  29.14 
 
 
678 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.14 
 
 
686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.42 
 
 
722 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.17 
 
 
699 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.9 
 
 
694 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  28.82 
 
 
649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.99 
 
 
383 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  27.44 
 
 
703 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.09 
 
 
711 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.5 
 
 
711 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  27.22 
 
 
711 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  28.95 
 
 
653 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  26.37 
 
 
671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  25.78 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  26.24 
 
 
692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  26.4 
 
 
615 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.65 
 
 
383 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
774 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  27.69 
 
 
650 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  28.7 
 
 
641 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  27.65 
 
 
720 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.93 
 
 
676 aa  110  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  28.12 
 
 
650 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  27.83 
 
 
650 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  28.05 
 
 
732 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  27.83 
 
 
650 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  26.37 
 
 
688 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  28.74 
 
 
653 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  28.45 
 
 
658 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.76 
 
 
694 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.52 
 
 
723 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  25.5 
 
 
655 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  27.33 
 
 
654 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  28.45 
 
 
718 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  24.6 
 
 
703 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  24.73 
 
 
703 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
629 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  29.23 
 
 
1388 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.2 
 
 
679 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  26.93 
 
 
720 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  24.73 
 
 
703 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.01 
 
 
989 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  23.89 
 
 
652 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  24.47 
 
 
703 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  25.54 
 
 
716 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.78 
 
 
721 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  27.25 
 
 
669 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  28.32 
 
 
641 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  28.77 
 
 
661 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  26.36 
 
 
1033 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  27.3 
 
 
727 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.59 
 
 
658 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.87 
 
 
440 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  26.67 
 
 
727 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  28.61 
 
 
641 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  23.23 
 
 
658 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.75 
 
 
698 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3287  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.32 
 
 
641 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5081  hypothetical protein  28.32 
 
 
641 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615505  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  29.28 
 
 
639 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4016  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.87 
 
 
265 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112727  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  23.21 
 
 
661 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5204  hypothetical protein  28.61 
 
 
641 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.08 
 
 
656 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0991  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.48 
 
 
670 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.996446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  26.17 
 
 
388 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  24.36 
 
 
549 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.07 
 
 
699 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  24.7 
 
 
659 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.48 
 
 
658 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5018  hypothetical protein  28.61 
 
 
641 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646307  normal  0.216934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4493  hypothetical protein  28.61 
 
 
641 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  25.12 
 
 
409 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.36 
 
 
713 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.8 
 
 
656 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5544  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.67 
 
 
267 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.86 
 
 
743 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  24.73 
 
 
678 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0123  Fe-S oxidoreductase, dehydrogenase subunit  27.27 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.79 
 
 
683 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.3 
 
 
655 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  25.98 
 
 
661 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  25.47 
 
 
739 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.77 
 
 
717 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  25.8 
 
 
730 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.19 
 
 
664 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5887  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.21 
 
 
259 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11058  putative iron-sulfur-binding reductase  28.31 
 
 
262 aa  97.1  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.19 
 
 
664 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.86 
 
 
663 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>