More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7629 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  100 
 
 
342 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  63.53 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.29 
 
 
351 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.09 
 
 
344 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.09 
 
 
343 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.79 
 
 
345 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.53 
 
 
344 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.79 
 
 
344 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.12 
 
 
344 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.79 
 
 
334 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.58 
 
 
350 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.56 
 
 
349 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.4 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.42 
 
 
340 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  62.01 
 
 
329 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
345 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
343 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.42 
 
 
348 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
345 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.75 
 
 
351 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.48 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
348 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.09 
 
 
344 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.09 
 
 
344 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.88 
 
 
346 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  58.84 
 
 
344 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.61 
 
 
339 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  61.4 
 
 
340 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  59.76 
 
 
365 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  60.18 
 
 
339 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.14 
 
 
344 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.49 
 
 
346 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  56.73 
 
 
355 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.66 
 
 
347 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  57.75 
 
 
331 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.51 
 
 
345 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.08 
 
 
335 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.6 
 
 
344 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  54.79 
 
 
338 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  56.23 
 
 
354 aa  361  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  59.57 
 
 
340 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.17 
 
 
336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  57.14 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  56.59 
 
 
346 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.41 
 
 
332 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0325  molybdenum cofactor biosynthesis protein  52.28 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  49.24 
 
 
340 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3050  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.33 
 
 
338 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  49.41 
 
 
343 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  51.46 
 
 
337 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  53.33 
 
 
338 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.94 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1949  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  52.06 
 
 
343 aa  309  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.89 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.34 
 
 
329 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.34 
 
 
329 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.94 
 
 
327 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.24 
 
 
327 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.24 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.24 
 
 
327 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.1 
 
 
331 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.16 
 
 
329 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 
327 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.49 
 
 
327 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  47.27 
 
 
357 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.64 
 
 
327 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.73 
 
 
327 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.7 
 
 
331 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.11 
 
 
340 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.73 
 
 
327 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  49.7 
 
 
331 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  49.09 
 
 
330 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.73 
 
 
327 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  50.44 
 
 
331 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.29 
 
 
330 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 
328 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.15 
 
 
332 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.31 
 
 
328 aa  287  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.45 
 
 
332 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.75 
 
 
332 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
328 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  46.39 
 
 
327 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.8 
 
 
341 aa  278  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.7 
 
 
334 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.88 
 
 
327 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.84 
 
 
334 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.7 
 
 
334 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.7 
 
 
334 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.1 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.73 
 
 
328 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  45.32 
 
 
327 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.43 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.64 
 
 
328 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.39 
 
 
346 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.95 
 
 
596 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  41.67 
 
 
331 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  44.71 
 
 
323 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  41.19 
 
 
329 aa  245  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.71 
 
 
326 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.45 
 
 
326 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>